1) Что значит "исправить"? Это не поломка. Если поставить лошадь с одной стороны телеги и с другой так, чтобы они тянули в разные стороны, то ничего никуда не поедет :) Так и тут. Персонажем можно управлять (т.е. выбрать как сорс) либо контрол ригом, либо готовой анимацией.
Если Вы имеете ввиду, что нужно взять готовую анимацию, а потом подкорректировать её с помощью контрол рига, то сперва нужно перепечь её с сорса (обычно это протсо скелетик) на контрол риг, а потом создать доп слой и на нём делать корректирующую анимацию.
2) Да, нужно перепечь её на скелет, например.
Если всё это Вам непонятно, то лучше не спрашивать на форуме, Мошн Билдер "вещь в себе", со своими закидонами и "интуитивно понятный" - это не про него ни разу. Тут не получится скорее всего подсказать что-то одно, подсказывать придётся каждый шаг.
Поэтому смотрите уроки Сантуса - https://www.youtube.com/playlist?list=PLrrCvx6LQpILlQlNdoTjZ9GFGj4zB9HN0
Мошн Билдер имеет тот же "плюс", что и КАТ в 3Д-Максе или Майя Масл, например - со времени покупки продукта Автодеском развитие абсолютно остановилось и прекрасно подойдут и старые туториалы.
