чем вырезать сложную форму из предмета созданного с полигонами через connect

Ниче не понятно)

Вы хоть скрины приложите...)

про прикрепление изображения- вот пример стены с зарезанными полигонами. тоесть это бокс, которому коннектом были сделаны врезки и вытянуты. и соответственно уже при том, что это единый объект, имеются полигоны. 
мне нужно вырезать в этой стене углубление, (будущие врезанные перила) и вставить туда подсветку также 

возможно это, конечно, делается другим способом, но мне казалось очевидным применение проboolian 
(ну и вообще бывали не раз уже моменты, когда надо именно пробулить "сложны"объект) 

и вот как быть в таких случаях, потому, что на не "обычеый" бокс пробулиан не работает 

а если сперва вырезать, а потом зарезку делать, то полигоны ложиться будут вкривь и вкось 

ну,во-первых, если не работает пробулин, то просто булин обязательно сработает, во-вторых - там легче слайсом сделать диагон. разрез сверху и снизу и затем уже вдавливать внутрь насколько надобно, да и вообще - врезанные перила модели надо делать отдельно нижняя часть и отдельно верхняя

Я в последнее время вообще стал ленивый, если можно геометрию не трогать - (чисто для рендера то есть) то я использую Vray clipper или vray distance tex , т.е. использую чисто фишки врея - очень рекомендую - в таком примерно виде я на полке желаю ниши для треков встроенных да и в куче других мест где нужно сделать вырезы локальные. те же встроенные точечные светильники - тоже просто нерендерабельный объект для выреза и двигай его со светильником в любую сторону и клонируй сколько надо. В вашем случае тоже можно использовать  - а если прям геометрию -то  надо  либо всё аттачить в один объект и вырезать булеаном уже из него, либо( если глючит) то разделить на части и уже по отдельности из каждой части вырезать ваш внешний объект.

Если пользуетесь вреем - то почитайте про вышеназванные фишки - спасёте тонну времени и нервов. Вообще последние максы со смарт экструдом и врей со своими фишками прям сильно облегчили жизнь.