50 на 50, макс модификаторы накидывает ориентируясь на атрибуты геометрии, а если 1 раз всё перепутается, то на место может не встать.
А именно, Вы включили выделение точек на 5 модификаторе с конца и деформировали только часть геометрии с помощью ffd. Здесь перенос атрибутов на следующий уровень стека после открытия явно изменился и edit poly работает уже с совсем с другими точками. Можно попробовать повыделять заново, вспомнить как шла работа, попытаться точно повторить выделение и это может помочь, но маловероятно. Благо у Вас хотя бы не с нуля переделывать.
А вообще нужно взять за правило делать сколапшенные копии и кидать в скрытый слой, особенно если модификаторы работали только с частью геометрии. Большие стеки стараться избегать.