Ты на верхний полик применил инсет, потом экструд, потом - чамфер кромки, так? Там после инсета слишком близко сошлись угловые вертексы. Сколлапсь их, прежде чем экструдить-чамферить.
Я... думаю что тут алгоритм связки неправильный, а может я и неправ. Я всегда после каждой операции конвертирую (в поли или в меш).
И нет проблем, а если и появляются всякие арты (артефакты), то велд, или слайс, или... ну смотря по ситуации. В данном случае я бы просто передвинул мувом эти вертексы. Вообще что это, т.е. чегно нужно добиться, так легче разобрать.