Сделать Multisub material, на нужное кол-во вариаций цвета плитки.
Всю плитку объединить в один меш и поместить сверху модификатор MaterialByElement, в котором указать кол-во составных материалов Мультисаба.
Если не нужна рандомность в цветовой вариации, а нужно конкретный узор составить - тогда MaterialByElement сверху не ставить, а на уровне элементов потыкать вручную всю плитку и поназначать им свои ID.