Непонятное отображение рака :-)

Если использовать турбосмуз то все норм становится: 

И как мне кажется из-за этого в Substance Painter выходит кака

накиньте модификатор Turn 2 Poly и конвертируйте в Editable Poly или еще куда.
При экспорте веса нормалей унифицировались, видимо.

А если, к примеру, убрать вообще все группы сглаживания с этих частей или флипнуть нормали, что-то поменяется?

Еще у меня всегда был крайний вариант: отдетачить вообще все полигоны в новый объект. Это если все остальное точно не работает.

Да уж, легких путей не ищете, там слишком много конкурентов ).

К сожалению не помогло.

проверил все через xView, все не до чёты что были давно исправил

Сработало, спс огромное, а то я уже хотел бросить этого рака

Допускаю, что я не совсем удачно выразился. Выделить всё и detach. Не самый сложный путь)