Почистить обе сцены пруне клинером, закрыть хром (если открыт в фоне), мержить и ждать. Пока мержиться, ничего с компом не делать, инет не читать итд. Если не помогло, перегрузить комп, открыть одну сцену, закрыть, потом другую, закруть и потом мержить. Про ошибки в сцене, думаю, говорить не стоит. Никаких потерянных текстур итд. Соответствие матов визуализатору тоже должно быть.