с выделением есть баг который кочует между версиями максов, пропадает если создать любой новый объект. я бы попробовал сбросить настройки макса, и обновить до последних сервис паков, а лучше на более новую версию. Конфиг тоже было бы полезно услышать
С масштабом всё в порядке, перебрасывал объекты через .fbx в новую сцену и там начиналась та же вакханалия. Баг с выделение не фиксится через создание.
Версия 3ds Max Design 2015, если важно.
p.s. грешу на некорректное запекание Rayfire, могло оно вызвать подобные проблемы?