Я бы предположил, что разные системные юниты или есть масштабирование на объектах. Может и то, и другое.
Ещё есть смысл проверить, действительно ли она разбросана или просто отображается так. Так бывает при изменении размеров объектов рескейлом, особенности кэширования геометрии вьюпортом макса. Проверить можно накинув полиселект. Но если размеры не менялись, то это не то.