У меня похожая картинка получалась, рендер на локальном компе. Оказалось, что проблему создает объект с материалом CoronaLightMtl. Это был фрагмент цилиндра за окном для создания фона/пейзажа с примененным к нему материалом CoronaLightMtl, у которого в настройках Light emission была включена галка Emit light. Причем квадраты появлялись не везде, а местами, где свет отражался. После снятия галочки Emit light, квадраты пропали.