Цитата nnnkkk:
При этом галочки Backup on Save и Auto Backup как были сняты, так и остались.
Если имеется в виду сохранение файлов с добавлением _backup, то эти галочки ни при чём. Их как раз надо поставить обязательно.
А за _backup отвечает как раз галочка Backup Original Files в сценконвертере, так что проверь ещё раз, действительно ли она снята.
Ну или возможно скриптовирусы, тогда установи 3ds Max Scene Security Tools.