Каждый ИС в отдельный рендер пасс. Рендерите в EXR чтоб не терять информации. Потом в Нюке/Афтер Эффекте/Фьжене каждый ИС меняете цвет/экспозицию/что нужно и ставите ключи на это дело. Быстро и просто.
Если норм владеете композом, то можно взять ещё пассы ЮВи и Поинт Позишн чтоб при необходимости переосветить в программе композа без необходимости перерендеривать.