Можно поставить плагин DynaMeshMaster, там можно задавать желаемое значение в полигонах. Или другой вариант: скейлишь уменьшаешь объект , пересчитываешь дайна мешем, потом скейлишь обратно. Так делали давнооо, когда плагина не было.
Просто вот это значение дайна меша 128 на вашем скрине - это в попугаях, он ориентируется на масштаб объекта. Походу вы замержили объект в старую сцену на место прежнего объекта, и дайна меш ориентировался по размерам старого объекта, а новый объект по сравнению с ним гигантский, поэтому и полигонов получается больше. Если замержить этот же объект в новую сцену, то, по идее, все должно нормализоваться.