В формате 3ds есть ограничение - не более 64тыс треугольников в 1-м обьекте и не более 64 тыс обьектов в файле. Соответственно, если какие-то обьекты в экспортируемом файле имеют больше 64 тыс полигонов, они не будут экспортированы. Выход, попробуйте аккуратно разделить большие обьекты на несколько мелких. Только смотрите чтобы сглаживание не мропало. Ну или восмольуйтесь другим форматом для экспорта.