При любом использовании булеана модификаторы смуфов(меш, турбо и т.п.) неприемлемы. Изуродуют все.
Как варианты:
- задать больше полигонов на бокале перед вырезанием.
- вместо вырезания осилить все-таки инструмент Cut.
- ознакомиться например с этим
http://www.3ddd.ru/modules/phpBB2/viewtopic.php?p=240682#240682
и развить темку )