Не хотел сразу отписываться, потому что вроде вопрос по Марвелоусу. Но поскольку ответов нет, а я имею что сказать, поэтому выскажусь.
Как в Марвелоусе делать, я не знаю. Анимировал флаги в After Effects через Zaxwerks Flag. Анимировал давно, лет пять назад, поэтому пошагово не расскажу. Ищите на торрентах, он есть, а на ютубе уроки. Если конечно софт не имеет значение, а нужен результат.