Проблема стандартная. Несовпадение единиц измерения. Самый простой вариант - это привести единицы в сцене в ту же, что и у анимации. Либо открыть анимированный объект в отдельной сцене, накинуть модификатор поинт кэш, закэшировать анирмацию, удалить скелет, перевести все в меш, накинуть поинт кэш и загрузить анимацию. Сохранить и затем уже мержить в свою сцену.