Спасибо, мне плагин помог. Минус 64 Мб к пустой сцене, стала весить 622 Кб. Он показал данные пустой сцены. Оказалось, были сохранены 3 варианта Scene state. Соответственно, Tools - Manage Scene States... - Delete.
Эти варианты сцен хранились с давних времён. Не заглядывал в них, забыл.