а у вас в тех стенах случайно нет проемов?
У меня такое бывало когда я пыталась выделить все стены и разом их подрезать. А когда подрезала по одной - то все было нормально. Или возможно вы выделили стену вместе с колонной и получается такой косяк..
А вот еще, вспомнила. Когда крыша состояла из разных кусков под разными углами. И пришлось стену разделить на 2-3 части - по одной части для каждой крыши.