попытался совместить результаты, посмотреть на сколько они разные.
Вот более точный способ сравнить разные меши на соответствие друг другу, показываю, может кому тоже пригодится. Метод основан на использовании Ambient Occlusion. И работает на любых рендер движках где такая функция есть. Обоим объектам назначается один мат где на диффуз назначаться Ambient Occlusion с картой градиента, причём Ambient Occlusion должен работать во внутрь, ну или вывернуть нормали.
Если настроить как у меня то серый цвет будет означать, что меши различаются менее чем на 2 миллиметра, зеленый , что меши различаются менее чем на 4 миллиметра, итд. чёрный , что меши различаются более чем на 8 миллиметров, Что при размере пня в пол метра по длинной стороне, и такой причудливой форме, я считаю приемлемым. Хотя можно таки протестить нейронку, но по одной фотке она сделает заведомо не правильно, а за генерацию по нескольким, мне не хото платить.